上海市崇明区科学技术委员会设下列内设机构：

（一）办公室。负责机关日常运转和综合协调工作。承担办文办会、机要保密、政务公开、档案、信访、信息化建设、工作督查、后勤保障等工作。负责财务和资产管理工作。负责机关和所属事业单位干部人事、机构编制、队伍建设等工作。承担党建、统战、宣传、党风廉政建设等工作。履行外国专家来华工作管理职责。

（二）科技综合科。编制区科技中长期发展规划并组织实施。负责落实推进国家及市级社会发展领域科技创新工作。组织开展科技攻关、科技成果推广（转化）工作。负责科技型民办非企业单位管理。负责管理、协调、督促全区科普工作开展。负责科技交流、专家联络及举办相关论坛日常工作。承办科技进步奖推荐工作。

（三）创新服务科。负责大众创业万众创新工作，推进众创空间、科技企业孵化器等培育工作。组织开展高新技术企业培育和认定、技术先进型服务企业认定、科技小巨人（培育）企业认定等工作。组织开展科技创新资金、高新技术成果转化项目认定工作。承担上海张江高新技术产业开发区崇明园管委会办公室职能。

（四）信息化综合科。负责拟定区信息化发展规划。负责财政性投资信息化项目预审及绩效评估。组织协调智慧崇明公共信息资源开发利用与共享。负责协调信息基础设施建设。承担无线电管理工作。负责正版软件相关工作。负责指导企业申报市级信息化发展专项资金项目。负责推进工业互联网、两化融合等产业发展。