陈尧（党组书记、主任）：全面主持党组、行政工作。分管办公室。

黄晖（党组成员、副主任）：分管宣传思想、工业产业发展、经济运行、节能降耗、成品油管理、投资管理、产业结构调整和中小企业服务以及大调研和本系统依法行政等工作。分管产业发展科、经济运行科、投资管理科（军民融合）、区中小企业服务中心。协管组织人事科。联系央企、产业园区、长开办投资发展处、崇明经济促进会、崇明企业联合会、上海崇明工业园区企业联合会、老白酒协会等。

周金锐（党组成员、副主任）：分管组织人事、纪检监察、机关作风建设、粮食和物资储备、老干部、统战、信访维稳、综合治理、工青妇、武装、档案保密、东西部扶贫、代表意见和政协提案办理等工作。分管组织人事科、粮食物资科、机关党委纪委。联系粮油购销公司、粮油经营公司等。

缪冬英（副主任）：分管商业经济运行、商贸发展、商业市场、外资外贸、食品行业管理、窗口行业和集贸市场创城以及有关进博会、本系统安全生产和创城创卫等工作。分管市场运行科、商贸服务科、外资投诉中心、服务环境指挥部办公室。联系崇明海关、外资协会、行政服务中心窗口等。

顾立超（调研员）：协管办公室、配合中心工作等。